Leta 1872 so v Dubrovniku ustanovili Patriotski muzej; sredi leta 1873 so v stavbi komune naredili prvi muzejski prikaz. Med eksponati, ki so večinoma iz obdobja Dubrovske republike, so kljub temu izstopali arheološki predmeti, na primer egipčanska mumija, grške vaze in starodavne amfore. Donatorji so bili zbiralci, vodilni člani patricijskih družin, mornarji in Dubrovčani živi drugje. Najpomembnejši med njimi so bili veliki dobrotniki in donatorji bratje Amerling, ki so bili strastni zagovorniki ustanovitve muzeja; dali so večino egiptovskih, orientalskih in japonskih predmetov, ptic, mineralov in redkosti vseh vrst. Leta 1882 je Arthur Evans, svetovno znani arheolog in pobudnik arheoloških raziskav na dubrovniškem območju, muzeju podaril tri rimske pogrebne napise iz Cavtata, prve vpise v knjigo podarjenih in kupljenih predmetov. Takrat je bila znanost o arheologiji je bila ustanovljena na Hrvaškem v začetku 20. stoletja, ljubitelji starin, zbrani okoli dubrovniške podružnice Hrvaškega antikvarskega društva v Kninu in Braće Hrvaške Zmaje, so začeli raziskovati porušeno cerkev svetega Štefana, nato pa je služil kot začasni lapidarij za predromanske skulpture. Leta 1932 je Patriotski muzej dobil uporabo prvega nadstropja Fort St John, nato pa so bile prvič oblikovane zbirke, vključno z arheološkimi. Leta 1941 so eksponati shranjeni v pritličju kašče The Holes; najlepši primeri kamnite skulpture so bili razstavljeni v istem prostoru, kjer so ostali, dokler stavba ni bila spremenjena v Etnografski muzej. Nekateri kamniti spomeniki so bili preseljeni leta 1960, na predlog Društva prijateljev dubrovniških starin, iz Luknje v trdnjavi Bokar; tri leta kasneje je oddelek začel svoje prve arheološke raziskave. V devetdesetih letih prejšnjega stoletja se je spremenil v Arheološki muzej, del dubrovniških muzejev. Posestva so se zaradi nenehnih arheoloških raziskav večkrat povečala in so bila razdeljena na osem zbirk, ki zajemajo obdobje od zgodnjega neolitika do druge polovice 17. stoletja, torej do velikega potresa leta 1667 . Ker prostor za stalni prikaz še ni urejen, muzej na občasnih ali priložnostnih razstavah predstavlja bogato arheološko zgodovino območja Dubrovnika. V pritličju trdnjave Revelin, ki ji je bila dana v začasno uporabo, sta trenutno na ogled dve razstavi: zgodnjesrednjeveška skulptura Dubrovnika in okolice ter Revelin - arheološka raziskovanja / prostorski razvoj / livarstvo.