Začetek muzeja sega v leto 1872, ko je bil ustanovljen Patriotski muzej, saj je imel na svojih posestvih majhno zbirko umetniških del kulturnozgodovinske narave. Bolj sistematično zbiranje gradiva se je začelo po drugi svetovni vojni, zahvaljujoč pozivanju kustosa in prvega vodje oddelka za kulturno zgodovino dr. Boža Glavića, ki mu gre zasluga za selitev zbirke v rektorjevo palačo in postavitev prvega v razstava situ, odprta za javnost leta 1950. Sčasoma se je zbirka spremenila najprej v samostojen oddelek Dubrovniškega muzeja, nato pa v Kulturno zgodovinski muzej, sestavni del dubrovniškega muzeja. Gradivo muzeja je sestavljeno iz gradivo izrazito kulturne, zgodovinske in umetniške vrednosti, z okoli deset tisoč predmeti, ustvarjenimi v časovnem obdobju od konca 15. do začetka 20. stoletja. Sistematizirano je bilo v petnajst zbirk, ki vključujejo slikarstvo, grafiko, pohištvo, tekstil, keramiko, kovine, ikone, steklo, fotografije in fotografsko gradivo, razno, dokumente, razglednice, pisatelja Ive Vojnovića, staro orožje in numizmatiko. v Rektorjevi palači in je deloma obravnavano okoljsko, najbolj pa predstavlja umetniško in zgodovinsko dediščino zadnjega obdobja Dubrovske republike. Prav tako pričara verodostojen prostor zgodovinskih dogodkov, ki predstavljajo državne urade, sodno sobo in zapor v pritličju, kapelo, sprejemne prostore in rektorjevo lastno stanovanje s svojo študijo, osrednji prostor in spalnico na prvem nadstropje. Razstave Dubrovniški kovanci, medalje, pečati, grbi in mere, Orožarstvo, Zlatarstvo v Dubrovniku in Inventar Domusa Christia, državni apotekar, predstavljeni v mezaninskih sobah, dopolnjujejo teme, ki jih obravnava stalni prikaz.