Sbírka obsahuje přes 35 000 položek a zahrnuje archeologickou sbírku z období epidaurum, kterou dal dohromady B. Bogišić v roce 1898 během svého pobytu v Cavtatu. Knihovna, archivy, i každá ze sbírek muzea samostatně, jsou v odborných kruzích dobře známé díky mnoha raritám a jedinečnému vzoru; mezi nimi jsou zvláště důležité práce související s Chorvatskem.B. Bogišićova knihovna obsahuje přibližně 15 000 knih a brožur, přibližně 200 časopisů, některé noviny, 66 incunabula, 164 rukopisů a 165 map. Shromážděný archivní materiál je rozdělen do 39 tematických celků (zejména právní historie, lidové zvyky a literatura a Bogišićovy osobní archivy, které obsahují poměrně bohatou korespondenci čítající 10 092 jednotek a 1 481 korespondentů). Mezi muzeální sbírky patří zejména: vysoce hodnotná sbírka starých tisků (8 185 listů z 16. až 19. století), jedna ze tří největších sbírek tohoto druhu v Chorvatsku; a sbírka peněz a medailí z období mezi starověkým a koncem 19. století - malá, ale bohatá na obsah (číslo 2 674). Existuje mimořádně zajímavá sbírka předmětů, které mají právní a symbolický význam (přibližně 150 položek), což je v Chorvatsku ojedinělé. Zbývající drobné muzejní sbírky v Bogišićově odkazu zahrnují díla výtvarného umění a řemesel; zbraně a zbraně; etnografické a další předměty. Sbírku Baldo Bogišiće v Cavtatu založila jeho sestra Marija Bogišić-Pohl v letech 1909 až 1912.