El Museo Marítimo de Dubrovnik se encuentra en la Fortaleza de San Juan de Dubrovnik. Fue fundada en 1941 mediante la organización de una exposición llamada Maritime Roads y Dubrovnik a través de los siglos. El museo forma parte de la Academia Yugoslava de Ciencias y Artes desde 1949, y en 1987 se fusionó con el Museo de Dubrovnik. El museo está ubicado en la Fortaleza de San Juan, que fue restaurada después del catastrófico terremoto de 1979. La exposición permanente del museo se creó en 1986 y muestra la historia marítima de la ciudad de Dubrovnik y sus alrededores. La exposición presenta modelos de barcos de los siglos XVII, XVIII y XIX, numerosas banderas, cañones y otras armas, instrumentos náuticos, cuadernos, carpetas, diversos documentos, así como una valiosa biblioteca con muchas copias raras de libros y material de archivo importante.