Lokrum to zielona wyspa, porośnięta żyzną ziemią i bujną roślinnością. Jednak to, co leży pod tą cienką warstwą, jest wyraźnie widoczne tylko na brzegu: cała wyspa jest zbudowana z grubych warstw skał osadowych - wapienia i dolomitu. Skały osadowe skrywają ciekawą historię geologiczną sprzed milionów lat - kiedyś były część platformy węglanowo-adriatyckiej. Pozostałości platformy nadal tworzą krasowy region w Chorwacji, od Karlovac, Gorski Kotar i Lika po Istrię, chorwackie wybrzeże i Dalmację, ale jego największa część zatonąła pod Morzem Adriatyckim.